中心在全校率先开展了实验室开放运行。以实验课程为推动，开展实验内容和设备资源开放；以科技创新为推动，开展时间、空间、设备资源全面开放模式，并定义了完整的实验室开放管理模式。

我校实验室开放分为课内开放和课外开放两种模式。课内开放实验室是为满足教学大纲的要求，开设教学计划内的实验，由教学实验室承担。通常是实验室在网上公布空闲时间，学生网上选课预约（无班级边界），额满为止，适于大批量、多班次的基础和专业基础实验，开放时间、实验内容受课程大纲的制约，学生学习的自由度也在某种程度上受到制约，因此我们将这样的模式称为计划内开放；而课外开放则是图书馆式管理的全开放模式，实验室可向学生无偿提供教学资源（机位、仪器设备、指导教师、部分器材等），支持学生开展题目自选、方案自拟的实验或科研项目。课外开放适于学科竞赛和科技创新，由创新实验室承担开放运行工作。

中心的计算机基础实验室和计算机专业实验室采取课内开放模式，计算机技术创新实验室等其他实验室采取课外开放模式。其中，计算机技术创新实验室在实验室开放方面做得比较出色，取得很多成绩。计算机技术创新实践教学采用实验内容、时间和空间的全面开放的实验教学模式。创新实验室保持全天候开放（包括周末和法定节假日），开放时间为每天8:00～22:00。寒暑假期间也按需开放，保证充足的实验时间。在学生比赛和训练期间，根据需要进行全天24小时开放。学生进入实验室后，要求在实验室管理系统中刷卡签到，离开实验室时要求刷卡签退。创新中心采用中心主任+指导教师+学生创新团队的三级管理模式，该模式下每个创新团队都有一名专职指导教师进行1对1全程指导，包括学生项目立题、规划、研制过程管理以及项目结题等内容。创新实验室开放实现了信息化和网络化管理，能够满足学生自主学习的需求，在学生科技创新活动和学科竞赛方面获得了显著的成果。

实验室开放将消耗较多的资源，增加较多的管理工作量，也为实验室管理赋予新内涵，因此实验室开放运行成为教学改革的难点。为了解决实验室开放带来教师工作量加大的问题，学校对开放实验室管理与指导给予一定的工作量。中心制定了实验室教师坐班轮休制度，还利用学生助教和科研团队的研究生完成一些辅助管理工作。